В соответствии с пунктом 5 статьи 50 Закона О пенсионном обеспечении в случае смерти получателя, а также лица, имеющего пенсионные накопления в ЕНПФ и не достигшего пенсионного возраста в соответствии с пунктами 1-3 статьи 11 Закона, его семье либо лицу, осуществившему погребение, ЕНПФ выплачивается единовременная выплата на погребение в пределах размера 52,4-кратного МРП, установленного на соответствующий финансовый год законом о республиканском бюджете, но не более имеющихся на ИПС средств.
В случае, если остаток пенсионных накоплений на ИПС (Индивидуальный пенсионный счет) получателя после осуществления единовременной выплаты на погребение составит сумму, не превышающую размер минимальной пенсии, установленный на соответствующий финансовый год законом о республиканском бюджете, данный остаток выплачивается как выплата на погребение.

В соответствии с нормами подпункта 18 пункта 1 статьи 341 НК РК выплаты в пределах 94-кратного размера МРП, установленного Законом о республиканском бюджете и действующего на 1 января соответствующего финансового года, по каждому виду выплат, произведенные налоговым агентом в течение календарного года:

• для покрытия расходов физического лица на медицинские услуги (кроме косметологических) - при предоставлении физическим лицом документов, подтверждающих получение медицинских услуг (кроме косметологических) и фактические расходы на их оплату, или расходов работодателя на уплату в пользу работника страховых премий по договорам добровольного страхования на случай болезни - при наличии договора добровольного страхования на случай болезни и документа, подтверждающего уплату страховых премий по договору добровольного страхования на случай болезни;
• в виде оказания материальной помощи работнику при рождении его ребенка - при предоставлении работником копии свидетельства (свидетельств) о рождении ребенка (детей);
• на погребение - при наличии справки о смерти или свидетельства о смерти.

Указанные доходы освобождаются от налогообложения на основании заявления о применении корректировки дохода и при наличии подтверждающих документов.

Таким образом, доход в виде материальной помощи при предоставлении физическим лицом документов, подтверждающих кончину работника (свидетельство о смерти), подлежит корректировке в пределах 94-кр МРП в целях исчисления ИПН, ОПВ, СН, СО, ОСМС и ВОСМС.

Если компания выплачивает помощь, указанную выше 94-кратного МРП, то она не не облагается налогами, остальная сумма облагается всеми налогами, как и зарплата работника.

Сумма на погребение работника выплачивается членам семьи при наличии заявления и справки о смерти (чаще всего это супруги; при отсутствии ближайших родственников - детям, родителям).

Согласно подпункту 3 пункта 1 статьи 57 ТК РК трудовой договор подлежит прекращению по следующим обстоятельствам, не зависящим от воли сторон: в случае смерти работника либо работодателя - физического лица, а также в случае объявления судом работника либо работодателя - физического лица умершим или признания безвестно отсутствующим.

При этом датой увольнения признается дата смерти сотрудника.

Для оформления увольнения умершего сотрудника необходимо получить копию свидетельства о смерти, издать приказ об увольнении в связи со смертью работника.

Независимо от причины увольнения бывшему сотруднику всегда выплачиваются:

- заработная плата; больничный; денежная компенсация за неиспользованный отпуск;

 - заработная плата, не полученная в связи со смертью работника, выдается в порядке, установленном гражданским законодательством РК.

Согласно пп. 18) пункта 1 статьи 341 НК РК  из доходов физического лица, подлежащих налогообложению, исключаются  выплаты в пределах 94-кратного размера месячного расчетного показателя, установленного Законом о республиканском бюджете и действующего на 1 января соответствующего финансового года, по каждому виду выплат, произведенных налоговым агентом в течение календарного года на погребение работника или членов его семьи, близких родственников - при наличии справки о смерти или свидетельства о смерти работника или членов его семьи, близких родственников.

В соответствии с пунктом 2 статьи 31 Закона в случае смерти лица, имеющего пенсионные накопления в Едином накопительном пенсионном фонде за счет обязательных пенсионных взносов (ОПВ), они наследуются в порядке, установленном законодательством Республики Казахстан. В вашем случае нужно будет выплатить сумму неперечисленных ОПВ работнику, доверенному лицу или наследнику (по завещанию или по закону).

Социальные отчисления в Государственный фонд социального страхования уплачиваются плательщиком через банковский счет Государственной корпорации не позднее 25 числа, следующего за отчетным месяцем. В соответствии с подпунктом 11) пункта 1 статьи 10 Закона РК «Об обязательном социальном страховании» Государственная корпорация осуществляет возврат плательщику сумм социальных отчислений, перечисленных за участника системы обязательного социального страхования, не имеющего индивидуального идентификационного номера, и (или) в реквизитах которого допущены ошибки.

В соответствии с Законом РК «О пенсионном обеспечении», Законом РК «Об обязательном социальном страховании», Законом РК «Об обязательном социальном медицинском страховании» с доходов, начисленных умершему работнику, не уплачиваются ОПВ, СО и отчисления и взносы ОСМС.

Таким образом, с дохода умершего работника ОПВ, СО, ВОСМС и ОСМС исчислять и удерживать не нужно, а ИПН у ИВ и СН нужно будет перечислить в бюджет.